发烧指发热，发热三天后头晕可能是生理因素，也可能是免疫力低下、脑供血不足等病理因素导致的。具体情况如下：
一、生理因素
如果在疾病治疗期间没有养成良好的睡眠习惯，长期熬夜可能会导致精神疲惫，出现头部胀痛现象。注意多休息，避免过度疲劳。
二、病理因素
1、免疫力低下
通常与维生素缺乏、睡眠不足、运动量过少等有关，可能会导致免疫功能下降，出现身体不适现象，可以在医生建议下服用匹多莫德口服液、玉屏风散等药物治疗。
2、脑供血不足
发热期间，容易导致身体大量出汗，造成血容量减少，引起脑组织供血不足，出现头晕、头痛等现象，可以在医生的指导下使用盐酸氟桂利嗪胶囊、盐酸倍他司汀片等药物来进行治疗。
除上述原因外，还可能是脑缺氧、脑出血、脑梗死等导致的。平时可以适当进行体育锻炼，来提高自身的免疫力。