孕妇发热39℃不一定会影响胎儿，需要根据发热的时间长短、原因以及用药等进行综合判断。
1、发热的时间长短
孕妇发热39℃是否会影响胎儿与发热的时间长短有直接性的关系。一般情况下孕妇发热及时发现，并针对性的治疗，通常不会影响胎儿。但是如果体温持续升高或者发烧反复，则会影响胎儿生长，容易出现胎心异常、发育迟缓等问题。
2、原因
孕妇发热39℃可能是着凉或者病原微生物感染引起的，对胎儿有无影响需要根据原因决定。如果是着凉引起的，一般不会影响胎儿，但是如果是病原微生物感染引起的，有可能会影响胎儿，容易出现胎儿畸形、早产等问题。
3、用药
孕妇发热39℃是否对胎儿有影响与服用的药物有关。在医生的指导下服用板蓝根颗粒、荆防颗粒等药物，一般不会影响胎儿，但是如果盲目服用药物，比如阿司匹林片、吲哚美辛片等，有可能会影响胎儿，导致胎儿心脏异常。
应该及时就诊，避免延误病情。在日常生活中要做好身体的保暖，多饮水。