6岁孩子总是半夜坐起来哭可能是受到惊吓、消化不良、感冒、缺钙、夜惊症等原因引起的，需要在医生指导下，根据引起的原因，选择合适的治疗方法。
1、受到惊吓
白天受到恐吓、惊吓，晚上睡觉时做噩梦等原因，导致孩子入睡之后，大脑皮层仍然处于兴奋状态引起的。建议家长采取安慰或心理暗示的方法进行治疗，平时尽量不要让孩子单独睡觉。
2、消化不良
由于6岁孩子的肠胃功能发育还不完善，吃过多不容易消化的食物之后，容易出现腹胀、腹痛等症状，当半夜出现腹部不适时，就会出现半夜坐起来哭的现象。建议在医生指导下服用醒脾养儿颗粒、健胃消食片、乳酸菌素片等药物，促进肠胃功能蠕动，帮助消化。
3、感冒
感冒会导致鼻子充血和分泌物增多，影响呼吸，尤其是平躺时，症状可能会有所加重从而影响睡眠出现上述情况。
4、缺钙
平时挑食、偏食的儿童，身体内缺乏钙离子等微量元素时，会导致大脑皮层兴奋性增高，出现夜间频繁惊醒、睡眠不安稳等症状。建议在医生指导下服用碳酸钙D3颗粒、乳酸钙片、二维亚铁颗粒等药物，补充体内所需要的钙离子，使症状得到改善。
5、夜惊症
夜惊症通常会导致大脑对外界刺激的过度敏感，在深睡眠中感受到某种刺激，如声音、光线或触碰等，可能会被异常激活，从而导致总是半夜坐起来哭。一般不需特殊治疗，特别是儿童期发病，大多在青春期后自愈。
如果症状长时间不能够改善时需及时到医院就医，完善相关检查后遵医嘱采取合适的治疗措施。